| PRSS16 expression based on | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BRCA : Breast invasive carcinoma
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Cancer stage information is not available/undetermined for 30 samples.
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Patient race information is not available for 109 samples.
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Patient gender information is not available for 10 samples.
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Patient age information is not available for 10 samples.
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
PR, ER or HER2 status by IHC is not available/not evaluated/ambiguous for 380 sample.
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Menopause status is not available for 96 samples. Thirty four samples with intermediate menopause status are not considered in the above plot.
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BRCA : Breast invasive carcinoma
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Tumor histology is not available for 3 samples.
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Nodal metastais status is not available for 2 samples and cancer in nearby lymph nodes cannot be measured (NX) in 20 samples.
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BRCA : Breast invasive carcinomaNote
Whole exome sequencing data is not available for 65 samples.
TP53 mutation status is obtained from TCGA whole exome sequencing data. We downloaded Mutation Annotation Format (MAF) files (derived from VarScan2) from Genomic Data Commons portal. The sample with/without TP53 mutation were matched with RNA-seq data
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